https://studiegids.vu.nl/en/courses/2024-2025/XB_430547Vertrouwd raken met modellen en methoden die gebruikt worden in computersimulaties aan eiwitten.Biomoleculaire modeling en simulatie is een belangrijke 'tool' om biochemische, farmaceutische en moleculair-toxicologische processen zoals (mis)vouwing van eiwitten en de interactie van medicijnen met eiwitten/enzymen te kunnen begrijpen en voorspellen. In de afgelopen jaren zijn biomoleculaire modellen (krachtvelden, interaction finger print methoden) steeds nauwkeuriger geworden, en zijn er steeds efficientere in silico methoden (virtual screening, free-energy methoden) ontwikkeld om bindingsaffiniteiten te berekenen.Tijdens de cursus zullen, aan de hand van door de docent aangereikte literatuur en praktische onderzoeksactivitieten, belangrijke recente ontwikkelingen op het gebied van bindingsaffiniteits-berekeningen en/of krachtveld-ontwikkeling in kaart worden gebracht.Toetsing vindt mondeling of schriftelijk plaats.Wordt beschikbaar gesteld door de docent.3FAls er minder dan vijf (5) studenten voor dit cursus inschrijven dan kan de opzet van het vak veranderen. Stuur dan een e-mail naar de docent om deelname te bevestigen.Het vak Moleculaire Modeling (X_435103) moet met een voldoende afgesloten zijn om aan dit vak deel te kunnen nemen.De onderstaande behandelen belangrijke stof ter voorbereiding op dit vak: Moleculaire Modeling (X_435103) Thermodynamica (X_430627) Statistiek (XB_43006